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@@ -44,22 +44,41 @@ Tout comme le test de Wilcoxon est la version non paramétrique du test *t* de S
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Dans ce tutoriel, vous allez pouvoir autoévaluer votre capacité à :
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-
- Déterminer quand utiliser un test de Kruskal-Wallis à la place de l'anova
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+
- Déterminer quand utiliser un test de Kruskal-Wallis à la place de l'anova à un facteur
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- Utiliser le test ce test non paramétrique pour résoudre des questions pratiques en biologie
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N'entamer ce tutoriel qu'après avoir compris ce qu'est une ANOVA à un facteur présenté dans le [module 10](https://wp.sciviews.org/sdd-umons/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons-2022/variance.html) du cours et vous être autoévalué via le learnr **A10La_anova** intitulé "ANOVA à un facteur".
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## Situation
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-
BLABLABLA
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+
Les données employées sont des données générées et ne proviennent pas d'une expérience scientifique publiée. Nous allons cependant ajouter un peu de contexte à cette expérience.
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-
Les données employées sont des données générées ne provenant pas d'une expérience scientifique publiée. Le tableau employé et le suivant :
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...
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+
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+
Il est intéressant de savoir générer de la données. Lorsque l'on souhaite par exemple préparer une expérience, il est important de réfléchir au protocole de l'expérience, à la structure qu'aura le tableau de données ou encore aux valeurs que l'on pense obtenir. Ces valeurs vont être estimée grâce à des études précédentes. Avec ces données, il est possible de mettre en place les analyses statisques que l'on va employer, les graphiques que l'on va réaliser,...
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+
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+
Le tableau est généré de la manière suivante :
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+
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+
```{r, echo=TRUE, eval=FALSE}
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+
# Fixe l'aléatoire pour des résultats reproductibles
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+
set.seed(43)
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+
# Création du tableau
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+
df <- dtx(
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+
group = as.factor(rep(letters[1:3], each =30)),
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+
yvar = c(
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+
rnorm(30, 10, 2), # groupe a : 30 individus, moyenne de 10, écart-type de 2
70
+
rnorm(30, 13, 3), # groupe b : 30 individus, moyenne de 13, écart-type de 3
71
+
rnorm(30, 6, 2)) # groupe c : 30 individus, moyenne de 6, écart-type de 2
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+
)
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+
```
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```{r, echo=TRUE}
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skimr::skim(df)
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```
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-
Votre objectif va être de comparer les moyennes des trois groupes.
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+
Vous pouvez observer que ce tableau comprend deux variables dont une variable facteur à trois niveaux et une variable numérique. Chaque groupe comprend 30 individus. Il n'y a pas de valeurs manquantes dans ce tableaux.
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+
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+
Votre objectif tout au long de cette séance d'expérience va être de comparer les moyennes des trois groupes.
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## Un peu de théorie
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@@ -160,7 +179,7 @@ grade_code("La variance entre les 3 groupes diffère au seuil alpha de 5%. Tente
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Vérifiez à nouveau l'homoscédasticité au seuil alpha de 5% en appliquant une transformation mathématique. Utilisez le logarithme népérien (`log()`)
grade_code("Vous avez réalisé le test adéquat à la situation. Comme vous l'avez remarqué, l'instruction a réaliser est simple. L'étape la plus importante est la suivante. Vous devez interpréter correctement ce test.")
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```
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211
193
-
```{rkruskal}
212
+
```{rqu_kruskal}
194
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question("Sélectionnez l'interprétation adaptée au test réalisé ci-dessus",
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214
answer("Les moyennes des trois groupes diffèrent significativement au seuil alpha de 5%."),
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answer("Au moins la moyenne d'un groupe diffèrent des autres significativement au seuil alpha de 5%."),
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