Hallo,

ich bekomme beim Laden meiner Daten mit SeuratDisk und Seurat v5 folgenden Fehler:

Fehler in unlist(x = assays.images, index$global$images) :
'recursive' must be a length-1 vector

Zusätzlich erhalte ich Warnmeldungen, dass das Argument slot in GetAssayData() und SetAssayData() veraltet ist und auf layer umgestellt werden soll. Diese Warnungen deuten darauf hin, dass SeuratDisk noch nicht komplett mit Seurat 5 kompatibel ist.

Mein Beispielcode (vereinfacht):

library(Seurat)
library(SeuratDisk)

Milkcells.sparse.m <- LoadH5Seurat("Pfad/zur/Datei/Milkcells.h5Seurat")

Der Fehler tritt direkt beim Laden auf.

SessionInfo:

R version: <4.5.1>
Seurat version: <5.3.0>
SeuratDisk version: <0.0.0.9021>

Bitte prüft die Kompatibilität und behebt den Fehler.

Danke!